1987 yılında Ankara’da dünyaya gelen Erdem Aydoğan, Kırıkkale Üniversitesi Mühendislik Fakültesi İnşaat Mühendisliği bölümünden mezun oldu.

Ankara’da bir mühendislik firmasında mühendis ve proje koordinatörü olarak çalışma hayatına başlayan Aydoğan, 2013 yılında Altyapı ve Kentsel Dönüşüm Hizmetleri Genel Müdürlüğünde, Emlak ve Dönüşüm Alanları Dairelerinde Mühendis olarak çalıştı.

Mülga Altyapı ve Kentsel Dönüşüm Hizmetleri Genel Müdürlüğü ile Kentsel Dönüşüm Başkanlığında Şube Müdürü olarak görev yaptı.

2024 yılında Kentsel Dönüşüm Başkanlığında Dönüşüm Alanları Daire Başkanı olarak atandı.